Shinichi Kudo est un détective lycéen dont le corps a rapetissé suite à l’ingestion d’un poison fabriqué par une mystérieuse organisation. Il habite chez son amie d'enfance, Ran, sous l’identité temporaire de Conan Edogawa. Grâce à Conan, le piètre détective, père de Ran, Kogoro Mouri est maintenant devenu célèbre.